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1、經適房和兩限房的審核標準、房屋購買價格還有日后轉成商品房的出讓手續及費用有區別。審核標準經適房和兩限房都有自己的管理辦法，針對各自的管理辦法，在對審核人的家庭結構、家庭資產、人員工資及審核準入線上，經適房要比兩限房的準入標準高很多，也就是說經適房的準入標準要比兩限房嚴格。
2、購買價格比較好理解，購買經適房或者兩限房，相對來說兩限房要比經適房貴一些，但是從審核標準來講，經適房要嚴一些。日后上市交易，經適房五年后可以上市交易，經轉商的手續相對繁瑣，且上市后差價的70%收益歸政府，居民只得30%，政府有優先回購權。
3、兩限房五年后上市，除去土地出讓金外，只需給政府35%銷售差價，就可以賣出或轉讓房子，且產權也是商品房產權。
