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基因重組有自然重組和噬菌體兩種類型，基因重組指的是在生物體進行有性生殖的過程中，控制不同性狀的基因重新組合。其發生在二倍體生物的每一個世代中。
每條染色體的兩份拷貝在有些位置可能具有不同的等位基因，通過互換染色體間相應的部分，可產生與親本不同的重組染色體。重組來源于染色體物質的物理交換，減數分裂前期，每條染色體有4份拷貝，所有的4份拷貝緊密相連，發生聯會。
這個結構稱為二階體，二階體的每條染色體單元稱為染色單體，染色體物質的兩兩交換就發生在不一樣的染色單體（非姐妹染色單體）之間。
