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腦干位于大腦下方，是大腦和脊髓之間的較小部分，呈不規則的柱狀形。腦干自下而上由延髓、腦橋、中腦三部分組成。延髓部分下連脊髓。
腦干是脊髓向上延伸的部分,其下端與脊髓相連，上端與大腦相接。
腦干內的白質由上、下行的傳導束，以及腦干各部所發出的神經纖維所構成。是大腦、小腦與脊髓相互聯系的重要通路。腦干內的灰質分散成大小不等的灰質塊，叫“神經核”。神經核與接受外圍的傳入沖動和傳出沖動支配器官的活動，以及上行下行傳導束的傳導有關。
腦干的功能主要是維持個體生命，包括心跳、呼吸、消化等重要生理功能
